Die beste Detektei Indiens sollte den tödlichen Unfall untersuchen, der 275 Menschenleben forderte, so das Eisenbahnministerium des Landes.
Eisenbahnminister Ashwini Vaishnaw äußerte sich nicht zu Einzelheiten.
Vorläufige Berichte deuten darauf hin, dass ein Signalfehler den Absturz verursacht hat, und die Ermittlungen unter Leitung der Bahn haben bereits begonnen.
Die Kollision von drei Zügen am Freitagabend war Berichten zufolge das schlimmste Eisenbahnunglück Indiens in diesem Jahrhundert.
Über 1.000 Menschen wurden verletzt und in Krankenhäuser gebracht. Einige Familien suchen weiterhin nach ihren Angehörigen.
Es ist unklar, warum das Railway Board, das höchste Entscheidungsgremium des Ministeriums, eine andere Untersuchung durch das Central Bureau of Investigation (CBI) empfohlen hat, obwohl andere Untersuchungen bereits angelaufen sind.
Das CBI untersucht hochkarätige Verbrechen wie Morde und große Finanzbetrügereien.
Am Sonntag behauptete Herr Vaishnaw, dass "die eigentliche Ursache" des Unfalls und die Verantwortlichen für die "kriminelle Handlung" gefunden worden seien.
Eine "Änderung in der elektronischen Verriegelung", so fuhr er fort, "war wahrscheinlich die Ursache für den Unfall.". Der Minister riet, den Abschlussbericht abzuwarten.
Die Ursache werde in einem Bericht des Kommissars für Eisenbahnsicherheit aufgedeckt, versprach er.
Die Bahn erklärte am Sonntag, dass ein Signalproblem und eine "Änderung im elektronischen Stellwerk" für den Zusammenstoß der Lokomotive und der Wagen des Coromandel Express mit einem Güterzug verantwortlich seien.
Das elektronische Stellwerk in der Eisenbahnsignaltechnik legt die Trassen für jeden Zug in einem vorher festgelegten Bereich fest und gewährleistet so die sichere Bewegung der Züge auf der Strecke.
Die Waggons des Coromandel Express wurden durch die Kollision auf ein drittes Gleis geschleudert, wo sie mit den hinteren Waggons des Bengaluru-Howrah Superfast Express zusammenstießen, der mit hoher Geschwindigkeit über die Strecke fuhr.
An Bord der beiden Personenzüge befanden sich Berichten zufolge mehr als 3.000 Fahrgäste.
Nach Angaben von Atul Karwal, Kommandeur der National Disaster Response Force (NDRF), wurden bei der Kollision mehrere Waggons zerquetscht. Um die Passagiere zu erreichen, mussten sich die Retter durch die Trümmer schneiden.
Um die Passagiere zu retten und die Leichen zu bergen, wurden Hunderte von Krankenwagen, Medizinern und Rettungskräften zum Unglücksort geschickt.
Am Sonntagabend berichtete Vaishnaw, dass der Zugverkehr auf den Gleisen, auf denen sich der Unfall ereignet hatte, wieder aufgenommen wurde.
Einigen Berichten zufolge werden noch immer mehrere Fahrgäste vermisst.
Oppositionsführer forderten Vaishnaw auf, die Verantwortung für die Tragödie zu übernehmen und zurückzutreten.
Die regierende Bharatiya Janata Party hat sie aufgefordert, den Unfall nicht zu politisieren.
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