Dee Forbes, die Generaldirektorin von RTÉ, ist mit sofortiger Wirkung zurückgetreten.
Moderator Ryan Tubridy erhielt 345.000 Euro (296.800 Pfund) mehr, als in den Gewinnberichten des irischen Senders zum Zeitpunkt des Wechsels angegeben war.
Die Zahlungen erfolgten zwischen 2017 und 2022 an den TV- und Radiomoderator.
In einer am Montag von Frau Forbes veröffentlichten Erklärung heißt es, sie habe sich "auf die Prozesse zur Beantwortung von Fragen im Zusammenhang mit Zahlungen an Ryan Tubridy eingelassen und konsequent mit ihnen kooperiert."
Sie fuhr fort: "Als Generaldirektorin bin ich letztlich für das verantwortlich, was innerhalb der Organisation geschieht, und ich nehme diese Verantwortung ernst.
"Ich trete mit sofortiger Wirkung von RTÉ zurück. "
Die Late Late Show, Irlands älteste TV-Talkshow, wurde von Herrn Tubridy moderiert, bis er kürzlich seinen Rücktritt bekannt gab. Der nordirische Komiker Patrick Kielty wurde als Nachfolger von Herrn Tubridy benannt.
Am Mittwoch soll der irische Rundfunksprecher vor dem Medienausschuss des Oireachtas (irisches Parlament) aussagen.
Danach folgt am Donnerstag ein zweiter Auftritt vor dem Rechnungsprüfungsausschuss.
Zusätzlich wird die Unternehmensführung des Senders einer unparteiischen externen Prüfung unterzogen.
Die Journalistengewerkschaft National Union of Journalists (NUJ) bei RTÉ begrüßte die Ankündigung und forderte eine rasche und transparente Überprüfung.